中心遵循“以学生为中心，以学生能力培养为根本”的育人理念，秉承东南大学“重基础、重实践、重素质”
中心以学生能力培养为出发点，结合“新工科”建设实践和学科的发展状况，不断完善“教学与科研融合、课内与课外结合、学校与企业协同”的实验教学体系。
1）校内实验课程体系
中心推广“以学生为中心"的教学方式，在教学中强调“理论与实验一体，线下与线上互补，延伸课堂时空”，调动学生的积极性、主动性和创造性。
中心参与研制了《生物医学工程本科专业规范》，《生物医学工程类专业本科教学质量国家标准（草案）》，在此基础上示范中心编写了本科生通过实验教学应达到的专业能力要求，形成了实验课程与学生能力培养标准的关联矩阵，作为对实验室资源配置、实验教学内容和质量评估的依据。
教材建设