为适应学科发展和社会对人才的需求，通过与企业共建培养方案，进一步优化和完善校外课程体系。建成了“医疗设备临床应用、质量检测及技术”、“高通量生物检测技术和组学数据分析和应用”、“可穿戴设备和健康大数据分析”、“疾病的生物标记分子检测技术和设备开发”4个涵盖“工程基础—工程应用—工程创新”三个层次的校外实践课程体系，由深圳华大基因研究院、生物材料与医疗器械研究所、江苏省医疗器械检验所、苏州市环境与生物重点实验室、北京诺禾致源科技股份有限公司、基蛋生物科技有限公司、南京市第一医院等各实践教育基地根据自身特点开设具体课程内容和提供认识实践、科研与工程实践、企业创新项目研究等实践活动。学生可从1-2个实践课程体系中选择部分课程完成实践教学要求，通过学习，具有较为完整的生物医学工程实践经历，具备从事生物医学工程研发的工程设计、工程实践能力，有分析生物医学数据的能力，部分校外实践基地课程如表1所示。
表1部分校外实践基地课程
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课程名称
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学时
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学分
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实践基地名称
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分子生物学与基因组学
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48
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3
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华大基因
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基因组学新技术（Solexa）
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48
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3
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华大基因
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生物物理及信息分析
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32
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2
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华大基因
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生物信息学技术（组装、甲基化分析、小RNA分析、SV分析等）
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32
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2
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华大基因
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生物医学检测新技术
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48
|
3
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华大基因
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专业文献阅读
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48
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3
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华大基因
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软件编程
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48
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3
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华大基因
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生命科学前沿讲座I
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32
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2
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华大基因
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生命科学前沿讲座II
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32
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2
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华大基因
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医药生物经济
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32
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2
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华大基因
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神经基因组学
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32
|
2
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华大基因
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动植物细胞工程
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48
|
3
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华大基因
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基因组测序综合实验
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128
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4
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华大基因
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基因工程实验
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64
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2
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华大基因
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生物信息学技术实践
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96
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3
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华大基因
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项目实践
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10周
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2
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华大基因
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毕业设计（论文）
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16周
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8
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华大基因
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校外毕业设计作为校外实践课程中工程创新环节的重要组成部分，各校外实践基地从各自开展的工程研究项目中设立子课题作为学生的毕业设计选题。表2是部分基于企业项目在实践教育基地完成的毕业设计课题。
表2 部分在企业完成的毕业设计课题
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序号
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企业毕业论文
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学生
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单位
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1
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第二代高通量DNA测序碱基识别算法的研究
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陈良
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华大基因
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2
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三七基因组研究
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傅元元
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华大基因
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3
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基于CG平台的人类外显子测序技术及数据分析软件开发
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孙凯文
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华大基因
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4
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利用RNA-Seq和Extracted-Ion
Chromatogram提升串联质谱鉴定率
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马纯威
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华大基因
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5
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用于太阳能LED路灯锂电池管理的MPPT系统的研制
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孟天
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江苏锂星科技有限公司
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6
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栉水母RNA编辑调控的特征以及功能分析
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俞倩
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华大基因
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7
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基于RNA-seq测序的小鼠肝细胞表达数据分析
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江苗苗
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华大基因
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8
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网上药房系统应用设计与开发
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江涛
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生物材料与医疗器械研究所
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9
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斗鱼镜面实验刺激前后的small RNA差异分析
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陈肇喆
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华大基因
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10
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使用机器学习的方法提升CG Zebra base-calling环节的准确度
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黄炎亭
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华大基因
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11
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油菜基因组的Bisulfite-seq分析
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李良伟
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华大基因
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12
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大花红景天基因组研究
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郝世杰
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华大基因
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13
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肿瘤基因互斥与共发生软件测评
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王玉珏
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华大基因
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14
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基于BGI-SEQ50测序仪的DNB光强值提取算法改良以及Bleeding校正
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王韬
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华大基因
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15
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果蝇气候适应的比较基因组学研究
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李子劢
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华大基因
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16
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单孔目性染色体演化层次分析
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耿云聪
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华大基因
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17
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中药对糖尿病大鼠肠道微生物群的影响
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朱家慧
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华大基因
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18
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一种胎儿快速3D成像方法的原型设计
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汤俊贤
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上海联影
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19
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新型CRISPR-Cas系统的PAM序列筛选
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徐颖
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华大基因
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20
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基于基因组的古代鱼特性研究
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蔡怡然
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华大基因
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21
|
基于微信的高血压慢病管理患者终端软件设计与实现
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盛蕾益
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华大基因
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22
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胃镜下基于卷积神经网络的图像相似性检索
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胡慧怡
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华大基因
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23
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基于深度神经网络的肺结节识别与肺癌诊断系统开发
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刘锦
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华大基因
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24
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人工合成酿酒酵母染色体多组学分析
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胡自溪
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华大基因
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25
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深度学习在RNA可变剪接分析中的应用
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张程
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华大基因
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26
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间充质干细胞功能亚群鉴定
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钟集杏
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华大基因
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27
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MHC分子与抗原肽段结合的深度学习
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张雨薇
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华大基因
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28
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基于深度学习的生物学年龄预测及健康评估
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王磊
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华大基因
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29
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新型HIV耐药鉴定和基因分型方法研究
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黄文娣
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华大基因
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30
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基于免疫遗传疾病目标区域的CNV分析
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杨雪
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华大基因
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31
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鸟类基因组中直系同源基因的鉴别及其演化分析
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蔡旻淇
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华大基因
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32
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医疗信息系统安全架构设计与应用
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薛诗静
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生物材料与医疗器械研究所
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33
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特定领域建模在互联网药事系统的设计与实现
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李辉
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生物材料与医疗器械研究所
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34
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互联网电子处方系统的设计与实现
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闫鹏坤
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生物材料与医疗器械研究所
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35
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互联网自动药房系统的分布式存储方案的设计与实现
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常忆欣
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生物材料与医疗器械研究所
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36
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自动药房系统中进药系统的设计与实现
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汪丽平
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生物材料与医疗器械研究所
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37
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药房自助终端系统的设计与实现
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胡敏达
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生物材料与医疗器械研究所
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38
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高内涵细胞培养光学控制平台系统设计与开发
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李星辉
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生物材料与医疗器械研究所
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39
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高内涵细胞培养箱环控系统的应用设计与开发
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陈萌
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生物材料与医疗器械研究所
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40
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多通道蛋白分析仪软件系统设计与开发
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张弛
|
生物材料与医疗器械研究所
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41
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新一代智能输注疼痛管理系统设计与开发
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王钟毓
|
生物材料与医疗器械研究所
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