示范中心依托东南大学生物科学与医学工程学院(韦钰院士于1984年9月创建)，目前有生物医学工程、生物信息学和智能医学工程三个专业，是全国最早设置生物医学工程专业的高校之一。 学院在成为教育部高等学校生物医学工程专业教学指导委员会主任委员单位期间，主持研制了《生物医学工程本科专业规范》（2010年）和《生物医学工程类专业本科教学质量国家标准（草案）》（2014）。

东南大学生物医学工程专业为国家级高等学校特色专业，2019年成为国家首批一流本科专业建设点，为教育部首批“卓越工程师教育培养计划”实施专业之一，已建成校企联合的“东南大学——深圳华大基因研究院国家级工程实践教育中心”，为教育部质量工程“医工结合长学制创新人才培养实验区”实施专业（2007年批准）。该专业也是“十二五”江苏省重点专业，入选“江苏高校品牌专业建设工程” I期（2015-2018年）和II 期名单。

生物信息学专业于2021年成为江苏省一流本科专业建设点，并于2022年成为江苏省高校品牌专业建设工程的特色专业。

东南大学生物医学工程学科为国家一级学科重点学科，位列教育部公布的世界一流大学和一流学科建设名单之中（2017年9月20日），2007年起，在教育部学位与研究生教育发展中心组织历次一级学科评估中，均位列全国第一或A+。拥有“数字医学工程全国重点实验室"(原”生物电子学国家重点实验室”)、“儿童发展与学习科学教育部重点实验室”和“江苏省生物材料与器件重点实验室”等优质科研平台，有一大批科研资源被转化成实验实践教学资源、利用科研资源开展学生实践活动，奠定了专业实验教学在全国的引领地位。