中心运行遵循“开放、共享”的原则，中心建设纳入学校和学院的整体发展规划，由中心主任统筹负责，教学指导委员会审核中心的建设和运行，中心设管理办公室，根据中心主任的安排负责日常运行，对实验教学、实验资源、实验安全、信息化建设等进行规范管理。

                                                        图： 中心运行管理框架

1）以学生为中心，全方位开放运行

中心把培养学生的能力作为教学的根本目标，在完成课堂教学任务的同时，将课外研学、科研训练、学科竞赛等贯穿于实验教学过程中，从课题、教师指导和中心资源等各方面全方位地为学生开展课外实践提供支持和服务。中心通过开放运行将实验从课堂内延伸到课堂外，有力地支撑了学生开展探索性实验、自主参与科研课题。

中心资源面向全校学生开放，学生通过安全考核后准许进入实验室进行创新实验活动。学生通过项目方式自由在学院间组队完成课外研学项目，申请使用相关的实验设备与设施。

2）立足国家级示范中心的标准，开展教学研究和改革，创新实验教学范式。

中心组织教学团队的建设，系统开展教学体系、教学内容、教学方法、教学组织、教学评估等研究，编写实验项目教学质量标准。从政策上鼓励和支持教师开展教学改革、开展跨学科实验教学项目建设、教学仪器设备的自主研发等。中心和学院将承担教学改革项目作为教师绩效和升职的考核标准。

 针对生物医学工程多学科交叉和医工结合的特点，面向生命健康并紧密围绕国家临床诊疗与医疗器械行业的需求，依托一流学科平台，将东南大学生物医学工程一流学科的创新成果转化为优质教学资源，构建了科教融合型实验教学体系。“生物电子学综合实验”、“生物医学传感器设计实验”、“医用电子系统课程设计”等课程遵循科教融合、产教融合、医工结合与思政引领的原则，设置的实验内容来源于东南大学生物医学工程学科、数字医学工程全国重点实验室（生物电子学国家重点实验室）、江苏省生物材料与器件重点实验室等科研人员多年承担国家重大、重点项目以及产学研转化项目的创新成果，经过提炼、设计而成综合性创新实验，并形成了多学科交叉的、由前沿科研活跃的研究人员组成的教学团队。