中心遵循“以学生为中心，以学生能力培养为根本”的育人理念，秉承东南大学“重基础、重实践、重素质”的育人传统，努力践行东南大学“卓越化、国际化和研究型”的高层次、复合型创新人才的培养目标，根据生物医学工程专业理工医融合的内在要求和东南大学自身的特点，在中心的建设和教学实践过程中始终坚持以下教学理念： 

（1）以夯实基本功和提升综合素质为先导

中心秉持人的创造力来自于扎实基本功和良好综合素质的教学理念，从“专业基础性→综合设计性→研究探索性”三个层次建立了包含校内实验课程、课外实践课程和校企联合实践课程三类实验课程。通过强化课内、贯通课外、校企结合开展实验教学，在教学过程中注重训练实验基本功和提升综合素质。

（2）以培养具有家国情怀和创新能力的学生为根本

中心始终把握人才培养这个目标，将思政教育和创新能力培养贯穿于整个教学过程中，在多层次、立体化、综合性的体系上培养具有担当的领军人才。

在基础实验课程上强调创新思维过程，培养创新意识；通过综合设计类实验课程训练创新能力；有效整合课外研学、科研训练、学科竞赛等实践活动，将实验教学延伸到工程训练、企业实践项目中，力行“做中学、做中研、做中创”，在应用实践中加强创新能力的锻炼。通过多种途径的科研实践训练环节，学生参与到教师的科研课题，提升了科研认识，体验到科学研究的乐趣和精髓，有效培养了创新意识和创新能力。

（3）以强化理工医复合的知识结构为显著特色

中心在实验课程体系建设和教学过程中，根据专业人才培养标准，注重强化理工医结合的知识结构特色，通过学校理工基础方面的优势强化基础，通过建立联合教学实验室强化与医学的结合，通过采用“平台+模块”的模式灵活适应不同专业方向的学生需要，结合课外、校外实验实践教学，训练学生理工医结合解决实际问题的能力，培养生物医学工程复合型人才。

（4）以教学科研融合和校企协同育人为核心模式