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课程名称：生物信息学技术实验
英文名称：Bioinformatics experiments
课程编号：
面向专业：生物医学工程
学时学分：32学时 2学分
本大纲主撰人：孙啸 杨锡南（Tel：83795174，E-mail：xsun@seu.edu.cn）
一、 本实验课程（在人才培养中的）作用和具体目标
“生物学信息学技术实验”是为“生物学信息学技术”课程配套专门设置的实验课程，该课程主要面向生物技术专业方向的学生。本课程的教学目的是使学生了解各种生物信息资源和生物信息学数据库，了解生物信息学中的数据集成及数据挖掘，熟练掌握生物信息学的基本方法和基本技术，熟练使用生物信息学分析工具，并能够综合利用各种生物信息资源和分析工具解决实际问题。
二、实验课程内容、学时分配与组织
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序号
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实验项目名称
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内容提要
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实验性质
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实验类型
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学时分配
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每组人数
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备注
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1
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生物信息资源及数据库
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熟练使用各种生物信息资源和生物信息学数据库，了解生物信息学中的数据集成及数据挖掘。
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专业
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基本型
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4
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必做
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2
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生物分子序列的计算机处理
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利用计算机处理生物分子序列，掌握序列的交换格式，实现序列的基本处理。
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专业
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研究创新型
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4
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必做
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3
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SAS-1
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学会使用生物统计软件SAS
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专业
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基本型
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4
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必做
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4
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SAS-2
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了解数据分布特征的分析。
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专业
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提高型
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4
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必做
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5
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SAS-3
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假设检验。
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专业
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提高型
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4
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必做
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6
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SAS-4
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分组特征的回归分析。
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专业
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提高型
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4
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必做
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7
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生物大分子结构预测
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熟练使用蛋白质二级结构预测的软件，掌握蛋白质二级结构结构综合分析方法。
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专业
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基本型
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4
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必做
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8
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系统发生分析
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掌握系统发生分析的常用软件。
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专业
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基本型
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4
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必做
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注：实验性质：指公共基础、专业基础、专业
实验类型：指基本型、提高型（综合性、设计性、应用性）、研究创新型
备注：指必做、选做
三、教学管理模式与注意事项
1． 实验课程采取统一管理模式，由指导老师统一安排实验时间，现场统一指导。
2． 要求学生在实验前认真预习并写出预习报告；实验中，认真操作，及时记录实验中出现的问题，并主动尝试问题；实验后，认真总结，分析实验结果，最后完成实验报告或论文。
3． 各人分别独立完成实验，每个实验的时间一般为4小时，由学生独立操作完成实验。
4． 加强计算机使用的管理。
四、设备与器材配置
1. 计算机；
2. 网络（要求能够访问国外数据库）。
五、考核与成绩评定
实验课程的平时表现占20％；“
实验成绩占80％。
六、教材与参考资料
1.《生物信息学基础》，孙啸，陆祖宏,谢建明,清华大学出版社，2005.
2. 《生物统计学题解及练习》，杜荣骞，高等教育出版社。
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